傳染性支氣管炎的生物學及流行病學
傳染性支氣管炎病毒(IBV)是已知冠狀病毒屬12種中的一種，其他還有豬傳染性胃腸炎病毒，及貓傳染性腹膜炎病毒。每一病毒粒在其脂質外膜上有二種醣蛋白。其一(S)形成大表面伸出物或穗狀體，它們使得陰性染色顆粒顯出"似皇冠"的外貌。另一種(M)小很多，僅有其20種左右胺基酸在病毒表面。在顆粒的內腔中就是重要的基因組。這樣構成一單件單股RNA(27,600監基)，四周環以核衣(N)蛋白質。還有第四種蛋白質SM，它與膜有關係。
根據它們蛋白質序列相同的程度，以及類別內相關抗原發生關係，冠狀病毒可以分成三類。傳染性支氣管炎病毒是其中一類中唯一的一種。IBV表現出很大的序列變化，尤其是S蛋白質之內。這一蛋白質在二項對家禽業極有關係的作用中，擔任了不可缺少的角色。第一，它是保護免疫性的主要誘發物，它誘發出病毒中和(VN)抗體，不僅在免疫性上擔負起要角，也是多年來用辨別變種的病毒中和試驗之基礎。
S蛋白質含約1,160胺基酸，可以分割成二部份；S1及S2，各含540及620個胺基酸。S1部份誘發VN抗體，也是這種蛋白質中最多的部份。至於S2部份，與其他病毒蛋白質一樣，在分離物中變化可高達10％。有些分離物中S1的不同到達48％，普通一般也有20％。這種S1的變化，可能就是一種疫苗株未能保護對抗所有IVB田間株的原因，而這一變化也在病毒株鑑別中產生出問題。為了安能建議出最好的預防措施，必須要對新的分離物檢定其特徵特色。多年來已經用VN試驗做了這件事，也鑑別出許多IBV血清型。
用VN方式去檢定IBV，有幾項缺點。其一是VN試驗的結果可疑，因為不能逆轉；另外有些分離物在序列上極為相關(S1的相同部份高於95％)，它們也有好的交互保護性，然而在VN試驗中的表現，是不同血清型。過去二年裡，已經知道了北魚IBV株的序列，比較其序列變化程度及交互保護性幅度，將會極有價值。
首先用單株杭體(Mabs)詳細分析IBV株的是荷蘭的郭士科(Guns Koch)氏及其同僚。他們在70年後期提出主要對付分離出荷蘭株的MAbs。他們採用雙倍抗體三明治酵素免疫吸附法(DAS-ELISA)檢驗MAbs，用了大量荷蘭與英國分離物(從70年代末至80年代初)及數次美國株。結果顯示許多歐洲分離物密切有關係，每種都會與所用16種病毒中和MAbs中多數結合。至於同時分離出的有些其他荷蘭株，卻少與MAbs中多數結合。測定序列已確認MAb有關分離物具有類似S1序列，而MAb不相關係株種，其S1有很大不同。對抗多項IBV株種的單株抗體，已在美國被開發出來供診斷及流行病學用，並已在數家實驗室中使用。曾企圖鑑別能分辨出血清型的少量"關鍵"性MAbs；這無疑會是一種有用的方法，不過IBV總是有例外。康乃爾大學的納奇氏(Nagi)某人檢查了結合二個VN-MAbs，它們在過去被認為是專門分屬Ark99及麻州血清型的。這一分離物(CU-T2)結合二者MAbs。
另外一種給病毒定特徵的方法，就是用反轉錄𠕇及聚合𠕇連鎖反應(RT／PCR)作為起點，去檢查其核酸。簡言之，反轉錄𠕇用來製造IBV基因組中挑出部份的DNA樣模(Copy)，它就是RNA。隨後聚合𠕇連鎖反應用以增大DNA到可使用量。這一過程之前不需純化RNA。從感染胚中取出一百微公升尿囊液，或是從氣管抹片取得的RNA，就足夠做多次聚合𠕇連鎖反應。為了要增大挑選的基因，用相IBV序列製成合成低聚核𠐟酸。這些低聚核𠐟酸平常長度該有20至25個核𠐟酸。為了要保證查出任何IBV株，需要一種相當於存在每一株種中的高度共有序列的低聚核𠐟。已經製造出的一些成對低聚核𠐟酸，它顯然對IBV是"很普遍化"的。
一旦IBV的存在被RT／PCR確認，DNA就可以定序列，或許是病毒定特徵的最後。對IBV說，總是有二種困難。其一是最出名的ST，它變化多，難以對主序列反應生產普通低聚核𠐟酸。這個問題尚非不可克服，但它使IBV的分析，比一些其他鳥病毒要困難得多。另一個是IBV進行重組：如果那是一種混和感染症，有些後代可能有來自雙親的序列。目前有間接證據，從田間分離物的序列資料，包括前述的CU-T2在內，許多IBV株命是重組產物。由於N基因比S1更普遍，所以只檢查N序列更方便。只是二種分離物可能有極近似的N基因，卻有很不相同的S1基因，反之亦是。因此，要對株種徹底測定其特徵，最好是定二個基因的序列，即S1及N，N從開始到結尾約有2千個核𠐟酸。如果重組已經在某時於這一介入地段發生，那末可以由二基因的序列部份查出來。如果二個分離物在N及S1的序列相同或極相似，那末就可以確實結論它們極密切相關。這是流行病學研究的重要資料。
當然並非總是要給PCR產品定序列，另外一種已經查驗過的變通辦法，就是用限制核酸內切𠕇，而後比較從一株與另一株的結果產物大小。喬治亞大學裘光吾氏(Jackwood)等人已經用了許IBV株做了這件事。他們的研究指出，一定血清型用選擇酵素，可產生S1基因之特徵性斷裂產品。產品在經過凝膠電泳後，可以很快及很容易看得見。目前可仍不知這種方法能運用多廣。
機會是研究會比田間IBV後一步，這對於像IBV易變病毒是很自然的事。MAb及核酸方法方便了株種的定特徵，也比以往更為準時。由這些方法得資料，會使選擇預防接種決策更好，至少可以更快一些。
家禽世界現代畜殖合訂本(p.11∼12)─鄧日青、九八年六期